以下の手順でアンインストールを行ってください。

「スタート」＞「コントロールパネル」＞「プログラムの追加と削除」＞nProtect Netizen Ver.5.0を選択し、「変更と削除」をクリックしてください。

基本的には問題ありません。
ただし、以下の点にご注意ください。
nProtect Netizen は、ActiveX という形態で起動するアプリケーションです。他社製品の中には、この ActiveXをセキュリティ上好ましくないものと考え、そのインストールや動作を完全にブロックしてしまうよう、最初から設定されている場合がございます。
そのため、お使いの環境によっては nProtect Netizen が正常に動作しない場合もございます。他社製品とご一緒にお使いになる場合、予めお使いの環境をご確認ください。
※ nProtect Netizen は、ActiveX を用い安全にパソコンをお使いいただけるよう設計されておりますので、ご安心ください。
※ 弊社では、他社製品の設定方法などについてはサポートしておりませんのでご了承ください。

「nProtect Netizen」の使用はお客様の任意で、パソコンのセキュリティ対策に不安がある方に使用をオススメしています。
例えば、もともとインストールされているセキュリティ対策製品のライセンスを更新していない、という方はセキュリティ製品が正しく動作していない可能性があります。
そのような場合に「nProtect Netizen」を使用することにより、セキュアな環境で事業者のサービスをご利用いただくことができます。
また、「nProtect Netizen」には他社製品にはないキーロガー対策の "KeyCrypt"という機能があります。他社製品と併用してお使いいただくことで、よりセキュアな環境を作ることができます。

はい、有効となります。
「nProtect Netizen」は、本体が起動された事業者のサイトを監視します。複数のウィンドウの中にその事業者のサイトが含まれていれば「nProtect Netizen」は起動し続けることができるため、有効となります。